记者从新疆大学了解到，新疆大学研究生培养机制改革自2008年9月起开始实行。实行培养机制改革后，硕士研究生的生活补助将从每月200多元增长到每月400元，其中自筹经费学生也将获得每月200元的生活补助。为了调动研究生的科研积极性，新疆大学还将实行普通奖学金动态管理。研究生入学第一年根据录取类别发放补助，第二年之后则按照学业评定结果动态发放补助，补助金额最高可达每月500元。
另外，新疆大学还将实行生源奖励制。对本科毕业于“985工程”、“211工程”高校的优秀推免生，将一次性奖励10000-5000元，报考部分特殊紧缺专业的学生将给予照顾。新疆大学还设立了研究生教育基金，由导师申请用于培养研究生，以确保研究生培养有项目背景和经费保证，从而进一步激发研究生的学习与科研工作的积极性，保证研究生的培养质量。