2002年4月28日桂林医学院体育教研室更名为体育部，现有教职工13人，其中副教授2人，讲师8人，助教3人。是一支朝气蓬勃的教学队伍。
体育部设有综合办公室、器材室。有体育场馆面积共计24367平方米，其中篮球场八个，排球场八个，300M塑胶田径场一个，羽毛球场十三个，乒乓球馆两个，健身房一个，健身美操房一个,形体房两个。课程开设有：篮球、排球、软排、气排、足球、乒乓球、健美、健美操、瑜伽、形体、拉丁、街舞、太极拳、太极剑、搏击健身操、搏击等。
2003-2006年共发表论文18篇，其中在省级及省级以上核心期刊发表论文5篇。通过培训学习，多人取得了国家一级裁判员资格，田径3人,篮球2人,排球2人,武术1人,足球1人，健美操1人，艺术体操1人。
在学生中成立了田径队、篮球队、排球队、足球队、健美操队乒乓球队。2003年以来，先后获得区级、市级大学生体育团体奖19项，单项奖125项。健美操队多次获得全国大学生健美操比赛第一名，2000年第四届广西大学生运动会中，获女子跳高第一名，男子铅球第三名等。2004年第五届广西大学生运动会中，获女子10000米第一名，大众健身操获第二名，女子跳高第二名，男子800米第二名，男子1500米第三名，男子铅球第三名，男子跳远第三名等。同时获甲组团体总分第五名。2006年第六届广西大学生运动会获田径比赛团体总分第六名，排球比赛男子第一名，女子第八名，篮球比赛男子第八名，女子第六名。2003年被评为广西壮自治区贯彻《学校体育工作条例》“优秀学校”。