微生物生态学：
本方向以极端环境微生物和病源微生物为研究对象，研究微生物类群多样性、适应机制、生理生化特征、遗传和进化特点，以及资源的开发利用与微生物之间的相互关系和作用规律，已在极端环境微生物区系生态与生物多样性、以及病源微生物和宿主之间的关系方面开始形成特色。