东华理工大学高等教育研究所前身是成立于上世纪80年代的高等教育研究室，隶属于学校教务处。2003年，高等教育研究室升格为副处级单位。2008年，高等教育研究所正式挂牌成立，为正处级独立单位。
目前，高等教育研究所共有专职研究人员8人。其中，具有正高职称的研究人员2人，具有副高职称的研究人员5人，具有中级职称的研究人员1人；5人具有硕士学历；3人具有本科学历。
东华理工大学高等教育研究所主要对学校改革、建设和发展中遇到的重大问题进行学术研究，为学校党政领导就本校改革、建设和发展中遇到的重大问题进行科学决策的咨询、参谋，同时也组织全校教职工开展高等教育科学研究。高等教育研究所负责国家、省级教育规划课题的申报组织与日常研究管理工作。承担对本校及抚州市其他高校教师岗前培训教学工作。负责编辑《理工高教探索》、《高教信息与参考》等校内刊物。参与学校发展规划的制定，为学校教育教学改革和创建国内高水平大学发展战略提供理论依据、政策参考和成功经验。
高等教育研究所还拥有校内兼职研究人员若干名，拟与省内外高等教育研究机构建立密切联系，逐步形成为具有一定实力和影响的研究团队。