温州医学院体育科学学院成立于2007年7月, 前身为1997年成立的体育部,现在学院下设体育部和运动人体科学系，承担了学校公共体育教学、群体、竞赛、训练和专业教学等工作。多年来，体育部全面贯彻党的体育教育方针和政策，积极推行教学改革，大力开展全民健身活动，在体育教学、竞技和人才培养等方面进行了积极地探索，为培养德、智、体全面发展的高素质人才做出了应有的贡献。
我校是浙江省唯一招收运动人体科学本科专业的高校，学院拥有设备齐全的运动人体科学实验教学中心，保证了运动人体科学专业的教学和实验需求。专业基础课的教学依托学校雄厚的医学师资力量，专业课教学由运动人体科学专业的高层次人才担任。学校生物实验中心、实验动物中心、机能实验中心及医学遗传重点实验室为运动人体科学专业实验教学提供了良好的保障。