东南大学近日决定，从2007年起试行研究生培养机制改革，将不再有“计划内”和“计划外”之分，只分全日制和非全日制研究生。同时将全面收取研究生培养费。报批中的收费标准为硕士生每年8000元，博士生每年12000元。
东南大学此次研究生培养机制改革的一个重要内容，就是设立研究生培养基金，实行奖助学金和“助研”岗位制，用于奖励和资助全日制研究生（单位委托培养研究生除外）。硕士生奖助学金分为四个等级：一等每年1.6万元，二等每年1.2万元，三等每年0.8万元，四等每年0.4万元。同时设立基础类、人文社科类及医学等学科硕士研究生专项基金，以资助研究生的培养。