通过专业的课程分享和传播知识是法国巴斯德研究所的优秀传统，上海巴斯德所学习和借鉴法国巴斯德研究所教育和培训方面的成功经验，始终把对青年科研人员的教育和培训、传播科学精神和科学知识作为对社会、对未来的责任。上海巴斯德所结合中国科学院、国内科学界人才资源和法国巴斯德研究所网络的人才资源优势，努力创造高水平的教学环境, 为我国生物医学科学界培养高质量的创新型研究人才。
上海巴斯德所教学中心为经选拔的学员提供高水平培训课程，由国内外知名科学家讲授。上海巴斯德所培训课程包括微生物学、病毒学、免疫学、传染性疾病、流行病学等领域。根据科研背景和参加培训动机选拔学员。课程内容覆盖传染病的各方面知识，既有综合定义，又有特定的病毒知识，为科研机构的青年科研人员提供良好训练。在生物安全培训中，我们让学生在实验室操作的各个重要环节中增加感性认识。自2005年5月至2006年12月，上海巴斯德所为研究生开设了“基础病毒学”课程，组织或联合组织了5次专门知识培训课程。来自亚太地区巴斯德研究所和国内科研机构的总计174名学员参加了培训。
这些课程首先面向国内科研人员，同时面向亚洲地区和巴斯德研究所国际网络成员，加强了巴斯德研究所网络研究人员之间的合作。
上海巴斯德所提供的培训和教育课程为研究人员提供了有效的分享前沿领域研究知识的渠道，为科学研究以及人才培养、对研究所的可持续发展起到了重要作用。