理学院是东北农业大学公共课教学与专业课教学融为一体的部门，由信息与计算科学系、生物物理系、应用化学系以及实验中心组成。理学院现有教职工九十一名，教师来自于吉林大学、南开大学、兰州大学、山东大学、南京大学、北京师范大学、哈尔滨工业大学、哈尔滨工程大学、东北师范大学等国内重点大学和省内综合性大学，具有学缘广泛的优点，是一支充满生机和活力的队伍。理学院现有教授8名，副教授19名。教师中有1名享受政府特殊津贴，1名获得霍英东青年教师奖，博士生导师4名，硕士生导师16名。
理学院承担着全校的博士生、硕士生和本科生的课程教学，具有应用化学专业硕士点、信息与计算科学专业本科点、统计学专业本科点、应用化学专业本科点。此外，招收数学生态学、系统工程、农药化学和食品化学方向的研究生。现有在校研究生75人，本科生234人。信息与计算科学专业学生曾获得美国大学生数学建模竞赛二等奖九人次，国家大学生建模竞赛一等奖5人次，二等奖4人次，省级建模奖项若干次。
理学院的科学研究方向包括：农业中的数学问题及其理论、概率论及多元统计分析在生态学中的应用、常微分方程的定性理论及其应用、农药合成及应用、天然产物的开发及其在食品工业中的应用、食品蛋白质化学及酶化学的研究。近年来，理学院主持国家自然科学基金、国家科委“十五”攻关课题、国家科委“九五”攻关课题、省科委“十五”攻关课题、省科委“九五”攻关课题、省自然科学基金项目、省普通高校骨干教师创新计划项目、省教育厅科学技术研究项目、教育部面向21世纪教学研究项目、省教育厅教学研究项目、学校教学与科研项目等二十余项。先后获得国家科技进步三等奖、省科技进步一等奖、省教学成果一等奖、省教学成果二等奖、省科技进步二等奖、省教育厅科技进步二等奖、省农业科技进步二等奖；主编面向21世纪高等农业院校教材三部、教育部“十五”规划教材一部、农业部“十五”规划教材八部、农业部“十一五”规划教材六部、国家“十一五”规划教材四部、高等农林类院校“十一五”规划教材九部；主持黑龙江省精品课程六门，发表教学和科学研究论文一百余篇，有多篇论文被SCI、EI收录。
目前，理学院在党、政领导班子带领下，正勤奋工作，努力拼搏，在各项工作上更上一层楼，创造新的辉煌。