吉林体育学院竞技教育系（处）于2003年11月成立，负责学院的竞赛训练和运动员大学生的教学管理工作。
吉林省从1999年开始进行运动员管理体制改革，学院领导带领体院人积极投身改革之中，以竞教结合、育人夺标为特色，以人文与科学融合的教改思想为指导，把为全省竞技体育发展服务摆到突出位置，把如何解决运动员“成人、成才、成功”和再创业的问题作为重要课题，担负着培养体育师资和培养竞技体育人才的双重任务，创建了具有吉林特色的教学、训练、科研三位一体的新型体院模式，被国家体育总局称为“吉林模式”。从而加快了我省竞技教育和我院体育教育的改革步伐，推动了优秀运动队管理院校化、训练竞赛中心化、运动员身份学生化的进程。为实现吉林省竞技体育事业的可持续发展，起到巨大的推动作用。
学院先后培养优秀运动员1000多名，夺取了世界、州际、全国各种运动赛事的多次奖项，先后培养了叶乔波、陈露、李佳军、李成江、张成烨、孙军、何颖等一批国内外知名的运动员。他们向全世界人民展示了吉林体院的竞教风采。