沈阳药科大学2014年招生的硕士研究生学制为3年。
根据《教育部 国家发展改革委 财政部关于深化研究生教育改革的意见》（教研[2013]1号）、《财政部、教育部关于完善研究生教育投入机制的意见》(财教〔2013〕19号）和《辽宁省财政厅、物价局、教育厅关于完善研究生教育投入机制的实施意见》（辽财教[2013]505号）等文件精神，从2014年秋季学期起，沈阳药科大学将向所有纳入全国研究生招生计划的新入学研究生收取学费。沈阳药科大学2014级硕士研究生学费标准不超过8000元/学年•生，具体以省发改委审批文件为准。
沈阳药科大学将设立2014级研究生奖助学金体系
（1）奖学金体系包括：研究生国家奖学金（博士3万/生 硕士2万/生），研究生学业奖学金（减免学费：非定向考生40%全免；40%免一半），研究生专项奖学金（石药、浙江医药、信谊等13个企业奖学金）。
（2）助学金体系包括：研究生国家助学金（博士1500元/月/生 硕士600元/月/生），研究生“三助”岗位助学金，研究生专项助学金（专项资助家庭经济困难研究生）。