组合数学中心由获得联合国教科文组织“侯赛因”青年科学家奖的组合数学家陈永川教授担任主任，荟萃了国内外组合数学界的一批优秀的青年学者，其中包括教育部长江学者特聘教授陈永川，国际数学化学科学院院士李学良教授，国际知名组合数论学者高维东教授，教育部新世纪优秀人才侯庆虎教授等。中心本着“取天下名师，集域内英才”的办学宗旨，逐步发展成为包括特聘教授、教授、副教授、博士后、访问学者和博士、硕士研究生在内的理论研究和人才培养基地。
著名数学家吴文俊院士、杨乐院士、万哲先院士、林群院士等时常关心组合数学中心的发展。吴文俊院士指出，每一个时代都有它自己的数学，而组合数学就是信息时代所需要的数学。国际数学大师陈省身先生多次参观组合数学中心，并称赞中心“办得很好，很先进”，“对南开数学充满信心”。
组合数学中心浓厚的学术气氛和活跃的学术交流也吸引了国际上一流的专家和学者。美国科学院院士George Andrews教授说：“南开大学有一个很强的组合数学团队。”世界著名生物信息学家，Michael Waterman院士对中心的发展非常赞赏，他说：“组合数学对于生物信息学非常重要，基于中心成立以来的发展势头，我完全相信中心将在交叉学科的研究领域获得突出的成就。”南开大学名誉教授，美国科学院院士Richard Stanley在组合数学中心举办的国际会议上表示，组合数学中心取得了令人瞩目的成绩，其发展速度实在令人惊讶，有潜力成为国际上最有影响的组合数学研究中心之一。