杭州师范大学基础医学部始建于1987年，是我校基础医学教育和研究的重要基地。基础医学部设有人体解剖学、组织胚胎学、免疫学与病原生物学、生理学、生物化学、病理生理学、病理学和药理学等8个教研室，1个基础医学实验中心（省级实验教学示范中心），1个市级重点实验室（医学神经生物学实验室）、1个二级学科硕士点（人体解剖学与组织胚胎学）以及3个校级重点学科（人体解剖学与组织胚胎学、生理学和药理学）。以下是杭州师范大学基础医学部导师介绍，现汇总如下：
| 黄茵 | 卢洪煊 | 田菊霞 |
| 林支付 | 汝海龙 | 张丽慧 |
| 刘传飞 | 史丽云 | 章志量 |