环境与能源学院（环能学院）成立于2009年，学院的办学目标是：建立新环能前沿学科，树立低碳科研教学培训典范，教育并储备有能力解决环能问题的科技人才，提供解决区域和全球性能源和环境问题的技术方案。建立与公众、政府和企业团体长期互动合作机制，共同努力为满足人类社会对能源和环境可持续发展的需求服务。
环能学院在北京大学本部环境科学与工程、生物学、化学等传统优势学科的基础上，结合深圳校区汇丰商学院、国际法学院、化学生物与生物技术学院等学院的专家资源，开展环能新兴交叉学科的研究与人才培养。学院综合考虑环境与能源问题，在解决环境问题的同时解决能源问题。我们研究的核心是把环境中的废弃物、污染物在治理的过程中资源化、能源化、并开发可再生、低碳能源新技术。本学院科研及技术发展的终极目标是在寻求区域经济发展，人类生活质量提升的同时研究并推广二氧化碳在大气循环中零排放技术，改善全球气候变迁的成因，最终帮助实现低碳和零碳经济。
学院目前设置了环境科学和环境工程两个招生专业，共有九个研究方向，包括：环境规划与管理、环境与健康、城市水环境与水资源、环境金融；水处理与资源工程、环境与能源信息、生物能源工程、环境微生物、能效工程。目前环能学院在校硕士和博士研究生123人，毕业生去向主要为国家机关、研究机构、学校、企业、出国深造等。