微生物学专业（071005）
微生物学专业以农业和环境微生物、普通病毒为研究对象，开展微生物和病毒的基础生物学、分子生物学和生态学研究，利用现代分子生物学手段对微生物和病毒进行遗传工程改良。在建立微生物和病毒遗传与信息资源数据库的基础上，利用微生物和病毒控制农业病虫害的发生，研究微生物对有机污染物的降解机理，建立动植物与食品有害微生物和病毒的快速诊断和检测技术。
研究方向：
1、微生物分子遗传学
主要研究微生物杀虫毒素蛋白特性、毒素蛋白作用方式及结构与功能间的关系、杀虫毒素基因及其它功能基因的克隆和表达、杀虫微生物的遗传改良、重组杀虫工程菌的安全性、害虫对生物杀虫剂的抗性机理及防治对策、微生物杀虫剂的发酵生产工艺及应用技术等。重点开展芽孢杆菌的基因组学和功能基因研究。
2、环境微生物学
开展微生物降解有机污染物的基础和应用基础研究。在生物化学和分子生物学水平上研究其降解机理和代谢途径，揭示降解基因簇和酶系的组成与功能、进化及其调控；运用优良降解菌种发展建立环境生物修复技术并进行修复中的分子生态学研究。
3、病原细菌
以重要临床感染病原细菌为研究对象，通过对细菌的群体感应（Quorum sensing）系统调控和相关重要功能蛋白的研究，从蛋白组和代谢组等水平揭示病原细菌生物膜（biofilm）形成、耐药以及耐酸的机理。
4、病毒分子生物学及基因工程
主要从事昆虫病毒的分子生物学和基因功能、病毒的基因工程方面的基础和应用基础研究。近期开展的主要研究工作包括昆虫病毒的超微结构，与杀虫性能相关的功能基因的鉴定，利用基因工程技术对杆状病毒进行遗传改良，重组病毒的环境生态学以及生物安全性评价等。
5、应用微生物学与基因工程
开展防病抗虫微生物、趋磁微生物、浸矿微生物等应用微生物的基础与应用研究。重点开展苏云金芽孢杆菌、趋磁细菌、浸矿微生物等微生物菌种和基因资源的发掘、功能基因组学、磁小体合成和微生物浸矿的分子机理等研究；利用基因工程技术，开展应用微生物菌株的遗传改良和优良工程菌的构建。开展趋磁细菌及其生物磁性纳米材料-磁小体的规模化制备技术、微生物冶金技术研究及新型Bt杀虫剂（包括基因工程杀虫剂）的研制和抗虫转基因植物研究，评价基因工程Bt杀虫剂和抗虫转基因植物的生态安全性。探索趋磁细菌及其磁小体在医学、污水处理等领域的应用和Bt抗人类肿瘤细胞等的活性及机理。
6、病毒分类学与分子系统学
运用病毒学传统分类与分子检测技术，开展重要医学病毒的溯源研究、病毒遗传变异和分子进化研究，重点开展流感病毒、出血热病毒和疱疹病毒的分子流行病学、分子生物学及病毒基因组学研究。同时开展新生病毒性传染病和重要人畜共患病毒病的分子流行病学研究。
7、生物信息学
生物信息学学科组主要研究驱动病毒进化的机制。从几个方面来研究这样问题。首先，通过比较基因组和系统发生分析，鉴别不同病毒之间的差异，以及了解这些差异是如何导致可逆的选择优势；其次，运用数学方法建立病毒感过程和流行病学模型；然后新开发用于知识发现的数据挖掘算法。生物信息学学科组的研究与研究所其他课题组及其他科研单位密切合作，对实验数据进行深入分析。目前所进行的研究对象包括HIV、HSV、JEV、Bacillus sphaericus和Yersinia pestis。