制药工程学科拥有我校最早设置的主要本科专业——制药工程专业，并从 2007年被批准招收博士和硕士研究生。2008年被授予国家级特色专业，也是辽宁省首批重点示范专业。本学科拥有一支在年龄、职称、学历等多方面结构合理的教学科研梯队。现有教师 56人，其中教授20人，副教授 24 人，高级工程师1人，讲师 9人，助教2人，具有博士学位的 32人。国外留学归来人员42人，占51.2%，来自于其它院校的毕业生或经过校外进修培训学习的教师约占55%以上。承担本科和研究生教学理论课和实验课30余门，近五年来，承担国家自然科学基金，国家863计划项目以及省、市重大科研项目近40项。在国内外学术刊物和会议上发表论文300余篇，申报专利10余项，出版教材等共14部。学科内拥有辽宁省创新药物研究与设计重点实验室，沈阳市创新药物重点实验室和一个校企合作实验室。
主要研究方向：
1．药物合成工艺设计与优化
2．绿色药物生产技术研究
3．手性药物生产技术研究
4．药物中试生产与应用研究
5．制药分离工程与工艺
6．药物制剂工程与工艺
7．制药设备优化设计