1、基本奖助学金
2006年作为首批三所试点高校之一，我校在全国高校率先探索和实施研究生培养机制改革，实施了硕士研究生基本奖助学金体系。2012年，我校对硕士生基本奖助学金设置与发放办法进行了调整，推免生和统考生第一学年基本奖助学金评定分开进行。校本部推免硕士研究生第一学年奖助学金体系包含基本奖助学金和优秀推免生专项奖学金，基本奖助学金覆盖所有录取的推免生，推免生专项奖学金用于奖励部分优秀推免生；校本部统考硕士研究生基本奖助学金覆盖95%的统考生，分为一等、二等和三等，额度依次为10500元/年、7500元/年、3000元/年。参加奖助学金评定的学生范围为我校拟录取的全日制硕士研究生（不包括软件学院、定向和委托培养类考生）。全日制专业学位硕士研究生奖助学金的评定与学术型硕士研究生完全相同。我校校本部2013年硕士生基本奖助学金设置与评定办法，待政策确定后，将通过我校研究生招生网对外公布。深圳研究生院与威海校区的奖学金体系参见深圳研究生院与威海校区的有关规定。
2、专项奖学金
学校设有由企事业单位、海内外知名人士设立的用于奖励优秀学生的各种专项奖学金近20种，主要有光华奖学金、宝钢奖学金、中国仪器仪表学会奖学金、IBM中国优秀学生奖学金、中国科学院奖学金、华为奖学金、SMC奖学金、海王奖学金、美的奖学金等，奖励额度为2000-5000元/年·人。学校还为航天、理科、力学学科的部分学生设立特殊奖学金，鼓励支持报考这些学科的优秀研究生。
3、三助岗位津贴
学校为学生另行提供教学助理、管理助理和研究助理（以下简称三助）岗位，通过承担三助工作使学生各方面的能力得到培养及锻炼，并获得相应的岗位津贴。根据岗位特点与工作量的不同，硕士研究生的助教、助管岗位津贴一般分为200元/月、300元/月两类，助研津贴额度由导师或设岗单位根据岗位要求确定。三助岗位设置及申请办法详见学校的有关规定。