学校针对全日制专业学位研究生设立奖优性质的“科学实践创新奖”（医学部、软件与微电子学院、深圳研究生院另行各自制定）。标准为10000元/人/学年，每年的获奖人数比例占全校专业学位研究生的10%左右。
除专业学位研究生、外国留学研究生以及其它经特别说明的研究生教育项目招收的研究生按其招生简章缴纳学费以外，各年度未获得奖学金的同学，也须按上述标准缴纳学费各学院（系、所、中心）根据实际需要设立助研、助教、助管岗位，根据岗位工作发放津贴。