导师姓名 霍红卫
导师类型 硕士生导师、博士生导师
工作状态 在职
职称 教授
最高学历 博士研究生
所属学科
硕士学科
(081202)计算机软件与理论
博士学科
(081202)计算机软件与理论
办公电话 88202363
办公地址 计算中心201
通讯地址 西安电子科技大学163信箱，710071
电子邮箱 hwhuo@mail.xidian.edu.cn
主页地址 http://web.xidian.edu.cn/hwhuo/
个人简历
1986年毕业于西北大学数学系，获理学学士学位。1991和2000年分别获得西安电子科技大学硕士学位和博士学位，专业分别为计算机软件与理论和信号与信息处理。2007年访问MIT，Harvard University和JHU。西安电子科技大学计算机学院教授，博士生导师，计算机软件与理论学术带头人。计算机科学系主任。曾获香港亿利达优秀论文奖，首届西安电子科技大学“十佳青年教师”称号，电子工业部科技进步三等奖（第一完成人），陕西省高等学校科学技术进步二等奖（第一完成人）。IEEE/CS会员。中国计算机学会高级会员。主持国家自然科学基金、博士点基金、预研、南京大学计算机软件新技术国家重点实验室、华为基金等多项科研项目。在《Mathematical and Computer Modeling》、《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》、《Chinese Journal of Electronics》、《计算机学报》、《软件学报》、《电子学报》、BIBE、CSB等国内外顶级刊物和会议发表学术论文60余篇。出版算法有关的著（译）作6部。
目前得到Jeffrey S. Vitter教授（http://www.provost.ku.edu/jsv/index.shtml）的邀请，即将赴美工作一年。
合作研究方向为external memory algorithms and compressed indexes。
主要研究方向及感兴趣的领域
外存算法和压缩索引，并行与分布式算法，生物信息学算法，云计算，算法工程
研究成果与着作、个人代表作、获奖情况
近期发表的主要论文：
1．Hongwei Huo, Zhenhua Zhao, V. Stojkovic, Lifang Liu, Optimizing Genetic Algorithm for Motif Discovery, Mathematical and Computer Modelling, Volume 52, Issues 11-12, pp.2011-2020, 2010.
2．Hongwei Huo, V. Stojkovic, Qiaoluan Xie, A quantum-inspired genetic algorithm based on probabilistic coding for multiple sequence alignment, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, Vol.8, No. 1, 2010, pp.59-75.
3．HUO Hongwei, YE Mangu, and GAO Dongpei, A memory-efficient multi- dimensional hardware-specific algorithm for packet classification, Chinese Journal of Electronics, 2010, Vol.38 No. 4, pp.634-636.
4．于强，霍红卫，高效存储的深度包检测算法，软件学报，2011，22(1):149-163
5．霍红卫，王小武，DNA序列中基于适应性后缀树的重复体识别算法,计算机学报，2010, Vol. 33, No. 4, pp.747-754.
6．Hongwei Huo and V. Stojkovic, A partition-based suffix tree construction and its applications, Advances in Greedy Algorithms, book chapter, Book edited by: Witold Bednorz, ISBN 978-953-7619-27-5, pp. 69-84, November 2008, I-Tech, Vienna, Austria
7．Hongwei Huo, V. Stojkovic, Qiaoluan Xie, and Xubang Shen, A probabilistic coding based quantum genetic algorithm for multiple sequence alignment, in Proceedings of the 7th Annual International Conference on Computational Systems Bioinformatics (CSB), Stanford University, California, USA, August 26-29, pp.15-26, 2008.
8.Hongwei Huo and V. Stojkovic, A Suffix Tree Construction Algorithm for DNA Sequences, IEEE 7th International Symposium on BioInformatics & BioEngineering BIBE2007, Harvard University, Boston, Massachusetts, USA, October 14-17, pp. 1178-1182, 2007.
9．霍红卫，白帆，一种具有精确边界的重复体识别算法，计算机学报, 2008, Vol.31, No.2, pp.214-219.
10．刘立芳, 霍红卫, 王宝树, 生物序列模体的混合Gibbs抽样识别算法，电子学报，2008, Vol 36, No.4 pp.750-755
11．霍红卫，肖智伟，基于最大权值路径算法的DNA多序列比对方法, 软件学报, 2007, Vol. 18, No.2, pp.185-195.
12．刘立芳, 霍红卫, 王宝树, PHGA-COFFEE：多序列比对问题的并行混合遗传算法求解, 计算机学报, 2006, Vol. 29, No.5, pp.727-733.
13. Hongwei Huo, Zhenhua Zhao, V. Stojkovic and Lifang Liu, Combining Genetic Algorithm and Random Projection Strategy for (l,d)-Motif Discovery, The Fourth International Conference on Bio-Inspired Computing: Theories and Applications, Oct. 16-19, 2009, Peking University, Beijing, China, pp.235-240.
14. Li-fang Liu, Li-cheng Jiao, Hong-wei Huo, A Greedy Two-stage Gibbs Sampling Method for Motif Discovery in Biological Sequences, Proceedings of the 2008 International Conference on BioMedical Engineering and Informatics, May 28-30, 2008, pp.13-17.
15. Hongwei Huo and Vojislav Stojkovic, Two-phase Quantum based Evolutionary Algorithm for Multiple Sequence Alignments, International Conference on Computational Intelligence and Security November 3-6, Guangzhou, China, 2006, pp. 374-379.
16. Lifang Liu, Hongwei Huo, Baoshu Wang, A Novel Optimization of Profile HMM by a Hybrid Genetic Algorithm, Journal of Information and Computational Science，2005, 2(4): 729-737.
17.Hongwei Huo and Hua Ming, Simulated Annealing with Star-alignment for Multiple Sequence Alignments, International Conference on Computational Intelligence and Security, 2005, LNAI 3801, pp.821-826.
18.Li-fang Liu, Hong-wei Huo and Baoshu Wang, Alignment multiple sequences by genetic algorithms, 2004 International Conference on Communications, Circuits and Systems, Volume II: Signal processing, Circuits and Systems UESTC, Chengdu, China, June 27-29, 2004, pp.994-998.
主要科研获奖
1．组合优化与计算几何方面的并行算法及软件，电子工业部科技进步三等奖，1998.
2．雷达成像处理并行算法及软件，陕西省高等学校科学技术进步三等奖，2001.
主要教材及译著
1．算法设计与分析, 西安电子科技大学出版社, 2010 第二版
2．算法I-IV（C实现）基础知识、数据结构、排序和搜索, 机械工业出版社, 2009
3．算法V（C实现）图算法, 机械工业出版社, 2009
4．算法学—计算精髓, 高等教育出版社, 2007
5．算法分析与设计, 人民邮电出版社, 2006
2~5为译著
目前承担的科研项目及教学情况
目前承担的科研项目
1．多核系统mapReduce模型及算法研究 国家自然科学基金
2．多核系统并行算法研究 博士点基金
3．协同软件支撑技术，预研
4．XML硬件加速，华为
教学情况
1．算法设计与分析
2．并行与分布计算
3．生物信息学算法